Вдоль СМП создана Арктическая зона, в которой применяется режим свободной таможенной зоны (СТЗ). Он освобождает компании от уплаты таможенных платежей, что упрощает ввоз, а также позволяет реализовывать инвестпроекты в наиболее удобном для инвесторов виде.
Например, завод «Звезда» в СПВ ввозит стройматериалы и комплектующие для демонтажа зданий/сооружений. После закрытия СТЗ все материалы остаются в собственности инвестора без необходимости их таможенного переоформления.
СМП стимулирует развитие портов по всей протяженности маршрута. Для оперативного оформления товаров необходимо также создавать здесь таможенную инфраструктуру.